JSU`s primære opgave er at skabe en positiv udvikling hos den unge, hvilket sikres gennem en målrettet miljøterapi, som bl.a. indebærer en forudsigelig struktur i trygge faste rammer og omsorgsfulde og troværdige voksenrelationer, der hjælper de unge med at erstatte et indre følelsesmæssigt kaos med mere positive følelser som tryghed, glæde, tillid, selvværd og meningsfuldhed.
På JSU arbejdes der derfor både individuelt med den unge og i gruppen med samvær og fælles oplevelser som omdrejningspunkt. Dette for at sikre den enkeltes personlige og sociale udviklingsprocesser bedst muligt, herunder lære den unge om samvær og integritet, hensyn og tolerance, ansvar og forpligtigelser, pligter og behov.